LhaForge166を使わせて頂こうかと思いましたが、自己解凍で作成した場合、解凍先フォルダーを指定（「解凍共通設定」-「解凍時の出力先」-「●指定した場所」）しても、自己解凍実行時のデフォルトの解凍先が、自己ファイルの保存先になってしまいます。

何か指定の方法があるのでしょうか？

残念ですが、自己解凍の場合、デフォルトの出力先を指定することはできません。
LhaForgeと自己解凍機能は別プログラムになっていて、指定できないのです。
(作者も別の方なのです)